本堂少年团契于1952年，在方明德师母大力鼓励下，4月14日正式成立。开始是由方师母任顾问，带领少年人认识真理，接受各种训练，使他们能热心服务教会。当时少年团契相当活跃，参加人数多。不久，方师母随方明德牧师调任星洲。
方师母以后，接继为顾问者为陈启昭先生，陈君任少年团顾问达18年之久，至1970年12月退任。陈君对少年团供献殊多，在他领导下的少年团活动极多，有球类比赛、清晨礼拜、退修会、报佳音队等组织。前陈君所领导的少年团员，现今有许多留学外国，有许多任青年团，成年团职员，甚而有任教会执事者。少年团对教会曾经表示他们的爱护，他们制作一大招牌赠送给本堂幼稚园，现在幼稚园的招牌就是他们爱教会的奉献。1970年圣诞前，少年团把教会的篱芭用银漆粉刷一新，这又是少年团爱护教会的表现。
1971年，少年团顾问由陈雪兰小姐与刘顺荣先生联合担任。在两人的努力工作下，少年团人数稍有进步。一年后，两位顾问因工作忙碌，辞了顾问职位。1972年与1973年在无顾问之下蒙主继续引领，少年团契工作照样进行。1974年得郭赳赳先生为顾问，一年后郭君又因世务忙碌而辞职。1975年开始，由罗华明先生带领。罗君整顿少年团契，使少年契友多受真理上的造就，让他们对圣经的眞理及属灵的事情有所认识，另一面也训练他们成为有责任感的基督少年。
前任顾问玉照
方明德师母 1952
陈启昭 1953-1970
陈雪兰 1971
郭赳赳 1974
少年团契留影 1952
圣诞报佳音队 1962
团员献诗 1973
会长切喜糕 1973
茶会掠影 1973
顾问罗华明及职员合影 1975
1979至1980年由陈珍宝女士担任顾问。陈女士是一位忠心的仆人，除了每星期出席少年团聚会给予辅导外，陈女士也常常在聚会中分享信息。少年团活动逐渐增加，除了有背诵圣经节比赛以鼓励团员多读神的话语外，少年团也常在学校假期到海边野餐及在教会附近分发福音单张。
1981至1982年少年团顾问由林逸云女士担任。从1983至1990年再次由陈珍宝女士担任顾问。少年团也在1987年举办了第一届的少年训练营。其主要目的是让团员更清楚自己的信仰。除此之外也训练团员在领唱、主持节目方面更能发挥自己的潜能。从1989年开始，少年团的聚会时间由下午3:30改换到晚上8:00，聚会地点也改在80周年纪念堂。
从1991年开始，少年团由黄牧师与少年团职员共同商议编排团契活动与聚会性质。直至1995年3月份执事会上，众执事鉴于黄牧师所负圣工日益加重，故议决委任三位执事为少年团顾问，同心协助牧师推动少年团契事工，让少年人在应有的关怀、照顾与栽培下茁壮成长，成为神合用的器皿。
顾问及职员留影 1995
少年团契全家福 1995
33周年纪念
青少年生活营升旗山 1995
青少年报佳音队
少年团升旗山营会留影 2004
少年团营会留影 2005
2015年，少年团契分为中小学组，各自都有负责的导师带领。每个星期的节目当中都以透过认识上帝，读神的话语、祷告、品格游戏等等所组成。希望这样可以让学员对神有更深的认识，并且促进学员之间的友谊，让他们对于团契拥有归属感，也从中启发他们在敬拜赞美的恩赐，并鼓励他们去事奉，成为合神使用的器皿。
目前，中学组的少年团契宗旨:【我是主门徒】与四大目标:【传承】【榜样】【纪律】 【分享福音】。这是为了装备他们日后在主日学、早堂敬拜赞美或者是其他岗位上的事奉，让他们了解到处事的谦卑，对神的顺服以及所作的都是以基督为焦点。
小学组的团契目标分为两方面。在属灵方面，引导孩子学习敬拜上帝，如透过唱诗、读神的话、经句、祷告、游戏、应用及实践神的话等。在生活方面，引导孩子学习关怀身边的朋友，如透过代祷、分享福音 、个人见证，更是以身作则常出席聚会。
少年团留影 2015
6月初，教区举办少年营长达3天，由青年人担任筹委会，少年人出席营会约80位，7个堂会的少年人参与，青年人及主日学老师同心协助指导，以运动来讲解侍奉态度。9月期间，本堂数位少年人前去原住民地区服事。此外，少年团联合成青及青年团一同前去韩江中学参加望道号(LOGOS HOPE)举办之赞美会。9月27日则拟定为少年主日。
2016年6月初，少年布道研讨会于马六甲举行，本堂7位青年人出席， 由陈凯翔导师带队。5月之年会少年大会，本堂委派庄恺信弟兄与李诗瑜姐妹前去参加。8月28日则定为少年主日。圣诞月期间，少年团举办了街道布道，以传扬福音，领人归主。
2018年8月4日，本堂少年团庆祝65周年纪念，缅怀先贤的贡献，一切荣耀归主。
2019年，本堂举办第一届青少年启发课程。
2020年，新冠病毒肆虐全球，多种危机牵动，世界格局加速演变与重构而令世人无所适从，而“新常态”是人人挂在口中的榜首之语。基于疫情爆发，大马政府于3月18日宣布全国进入行动管制禁令，以遏止病毒继续扩散。少年团契最后一次的实体聚会是3月15日。随着行动管制令的落实，我们不能探访团员或者进行实体聚会，但这并不影响我们敬拜神和对彼此的关怀。本堂团契把实体聚会转为线上聚会，让弟兄姐妹可以居家进行团契。除了学习神的话语，也给予团员时间来分享近况，彼此代祷，甚至一起禁食祷告（一餐）。疫情虽改变教会的生活，但都不影响团员们一颗向往团契的心志。感谢上帝！
2023年初，少年团恢复实体聚会。李仁民牧师指导整顿团契活动，聚会定于每星期六7.30pm – 9pm。在李牧师带领下，团员逐渐加增，平均出席人数达至30位。全年活动包有主题分享，Soaping，玩游戏学真理，球类比赛，生日会，外游等。此外，本堂共有19位少年人参与北教区所联办的“门徒联盟”生活营，受益良多。同时，本团定于9月16日外游，9月17日则为少年主日。2024年，少年团事工计划包含了门徒系列课程培训、男女关系讲座、群体外游、团队建设活动、接触世界福音动员会及与主日学连同协办3天2夜营会。
疫情后的生活方式虽有转变，但信实的上帝永不改变。在这动荡时代，愿少年团继续帮助团员们以正确及有效地方法读经，扎根于主的话语，与上帝建立美好的关系，成为主耶稣基督的见证人。感谢上帝的恩典与保守，少年人彼此扶持，齐心为彼此的身心健康、学业，以及国家代祷。愿上帝继续赐福少年团！
1952至2024年少年团契顾问
1952： 方明德师母
1963 – 1970： 陈启昭
1971： 陈雪兰/刘顺荣
1972-1973： 无顾问
1974： 郭赳赳
1975 – 1978： 罗华明
1979 – 1980: 陈珍宝
1981 – 1982： 林逸云
1983 – 1990： 陈珍宝
1991 – 1994： 黄约辉牧师
1995 – 2003： 黄约辉牧师，郑丽蓉，林素芬，曾如安
2004 – 2014： 黄约辉牧师，张振祥牧师
2015 – 2019： 黄约辉牧师，谭鸣晖牧师
2020： 张振祥牧师，谭鸣晖牧师
2021 – 2024： 张振祥牧师，李仁民牧师
团契目标：
- 帮助团员有效及正确的读经方法
- 帮助团员建立与上帝亲近的关系
- 在校园里成为主耶稣基督的见证人
2023-2024 年职员表
指导： 陈威荣执事
团长： 李康玟
副团长： 黄诗蔚
文书： 陈全敬
副文书： 黄奕森
财政： 李联俊
副财政： 庄勤宣
委员表
团契组：胡恩惠
事工组：陈伟畯
敬拜组：康燕玲
门训组：陈永敬
关怀组：周恩溢
小学组：陈恩乐